La formation intellectuelle en vue du sacerdoce revêt une importance de premier ordre. La préparation théologique et philosophique des candidats « apparaît comme l'un des meilleurs moyens pour offrir à la vie spirituelle du clergé et à son ministère pastoral un fondement toujours plus solide » (Congrégation pour l'Education catholique).

Le Pape Pie IX a confié une fois pour toutes la formation des séminaristes français aux pères jésuites de l'Université Grégorienne. C'est donc dans cette illustre institution, fondée en 1553 par saint Ignace de Loyola, que les étudiants

en théologie et philosophie effectuent leur tronc commun de premier cycle en ces deux matières (avec la possibilité d'arriver à Rome au début des études de théologie).

L'originalité des études à Rome se situe surtout au niveau du troisième cycle, à cause du grand nombre d'universités et de leurs spécialisations. Ainsi les étudiants de ce cycle qui pour la plupart sont déjà ordonnés diacres ou prêtres se répartissent suivant la licence ou le doctorat qu'ils préparent : à la Grégorienne pour la Théologie dogmatique, la Théologie Fondamentale et le Droit canon, à l'Institut Biblique pour l'Exégèse, à l'Athénée Saint-Anselme pour la Liturgie ou la Sacramentaire, à l'Institut Jean-Paul II pour la morale, à l'Institut Redemptor Hominis pour les questions sociales, à l'Augustinianum pour la Patristique, ou encore à l'Université du Latran, à l'Université de la Sainte-Croix, à l'Angelicum (Université Saint-Thomas d'Aquin), au Teresianum pour la spiritualité, à l'Institut Pontifical Oriental, à l'Institut Pontifical d'Etudes Arabes et d'Islamistique (P.I.S.A.I.).

Les cours sont donnés en italien, ce qui demande une bonne compréhension de cette langue ; il y a toutefois la possibilité de passer les examens en français.

Le Séminaire français ne se limite pourtant pas à offrir un cadre studieux pour le travail personnel. Outre les différents tutorats proposés par les Pères du Séminaire, ceux-ci participent à certains cours optionnels : méthodologie théologique, spiritualité, initiation à la prière liturgique... Divers groupes de travail s'organisent aussi spontanément entre séminaristes.

La bibliothèque du Séminaire, riche de 80.000 ouvrages et de nombreux périodiques, administrée par l'un des Pères avec le conseil de quelques séminaristes suivant leur spécialisation, est un instrument de travail et d'échange de grande importance.